Sinopse: Ren Amamiya, um novo estudante transferido da Shujin Academy, é enviado a Tóquio para morar com seu amigo da família Sojiro Sakura depois de ser injustamente colocado em liberdade condicional por defender uma mulher de agressão sexual. Enquanto está a caminho de seu primeiro dia em sua nova escola, Ren percebe que um aplicativo estranho apareceu em seu telefone, transferindo-o para um mundo conhecido como Metaverso, que contém as "sombras" das pessoas: representações distorcidas de seu verdadeiro eu. No Metaverso, ele desperta sua Persona, um poder profundo que lhe dá força para lutar contra as sombras. Com a ajuda de estudantes igualmente problemáticos, ele forma os Phantom Thieves of Hearts, tentando salvar as pessoas de seus desejos pecaminosos "tomando seu coração", fazendo os malfeitores se arrependerem de suas ações e virarem uma nova página. O grupo' No entanto, durante o pico de sua popularidade, Ren é capturado e levado sob custódia. Aqui, ele acorda para um interrogatório duro, mas isso é interrompido pela chegada de Sae Niijima – um promotor em busca de respostas. Como ela reagirá à história dele e o que será dos Phantom Thieves?