Sinopse: Após ser atropelado por um caminhão no ano de 2014, Akira Natsume acorda e se encontra dentro de uma máquina após um coma de 16 anos. Enquanto ele se ajusta à nova interface, ele é recebido pela policial Minami Uezono e sua parceira andróide Alma. A dupla mostra a Akira que seu cérebro está contido dentro de um dispositivo chamado EX-ARM — uma arma de destruição em massa. A bordo de uma nave contrabandista inimiga, os três devem escapar usando nada além de sua engenhosidade e habilidades de combate. Embora inicialmente relutante em lutar, Akira logo se lembra das palavras de seu irmão antes do acidente. A memória o inspira a agir, possuindo o corpo de Alma para lutar contra seus oponentes usando artes marciais. Assim que Alma o conecta a uma das portas da nave, ele descobre o potencial devastador de sua EX-ARM hackeando e assumindo o controle da embarcação sem esforço. Ao chegar em segurança de volta à terra, Akira conhece os outros membros da EX-ARM Countermeasure Prevention Team, uma divisão policial que trabalha para mitigar os efeitos dos EX-ARMs. Testemunhando as atrocidades cometidas por aqueles que buscam o poder dos EX-ARMs, ele resolve se juntar à equipe e acabar com o terror causado por essas armas.