Sinopse: Depois que Makoto Mizuhara concorda em testemunhar contra o turbulento presidente do conselho estudantil Katsuhiko Jinnai por subornar clubes escolares nas recentes eleições do conselho estudantil, Jinnai o persegue em uma tentativa de silenciar seu autoproclamado rival. De repente, durante a perseguição, o tempo para para todos — exceto Makoto. Perplexo, ele vagueia pelo campus até perceber uma luz vindo do porão fechado da escola, onde uma relíquia antiga tinha acabado de ser descoberta. Makoto está caminhando em direção ao artefato cercado por fios de luz, quando de dentro dele sai uma mulher de outro mundo que afirma estar esperando há dez mil anos para vê-lo. Enfraquecida pela passagem do tempo, ela usa seu poder restante para transportar um Makoto confuso para outro mundo, ao qual ela se refere como El-Hazard. No entanto, outros que ainda estão na escola também são pegos no feitiço, a saber: Jinnai; Masamichi Fujisawa, o professor alcoólatra; e Nanami Jinnai, a irmã teimosa do presidente Jinnai. O mundo fantástico e magnífico de El-Hazard aguarda esses quatro indivíduos, onde eles se envolverão na história de seus habitantes e embarcarão em uma aventura cheia de risos, perigos e até mesmo romance.